アジャイル開発によるモジュール構成で柔軟に
「iPad」で検体管理 国立長寿医療研究センターのバイオバンク事業を支えるシステム
国立長寿医療研究センターが2012年4月に発足させた「長寿バイオバンク」。その運用効率を高めるために同センターが採用したシステムを紹介する。
全国に6つある国立高度専門医療センター(ナショナルセンター)は2014年4月、厚生労働省の所管事業の1つとして「ナショナルセンター・バイオバンクネットワーク」(NCBN)を構築した。バイオバンクとは、同意した患者から手術や検査で採取した血液や細胞、組織などの生体試料を保存・管理し、病態の解明や新たな診断法/治療法開発などの研究利用のためにさまざまな機関に分配する組織だ。
NCBNは、各ナショナルセンターが専門とする医療研究領域に関する生体試料や付随する臨床情報をそれぞれ保管・管理するデータベースを構築。研究者や民間企業が各センターの生体試料や研究情報を検索できるようにした。本稿では、その中からナショナルセンターの1つである国立長寿医療研究センター(愛知県大府市)における、「国立長寿医療研究センターバイオバンク」(以下、長寿バイオバンク)を支えるITの仕組みを紹介する。
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長寿バイオバンクとは
国立長寿医療研究センターは、高齢者の心と体の自立を促進し、健康長寿社会の構築に貢献することを理念に掲げる。老化と老年病の研究、新しい医療技術を開発する役割を担う研究所、その研究成果を臨床的に生かした医療を提供する病院で構成される。また、認知症先進医療開発センターやもの忘れセンターなどの関連組織を持つ。2012年4月に発足した長寿バイオバンクも重要な組織の1つだ。
長寿バイオバンクは2012年9月、高齢者に多い認知症や関節疾患などの生体試料と診療情報を一元的に収集・管理する目的で事業が始まった。2015年6月末現在、4545人分の検体(事業開始前の既存検体を含む)が登録されている。NCBNは、同意患者の生体試料や診療情報の管理を各ナショナルセンターに任せており、国立長寿医療研究センターは「バイオバンク検体運用管理システム」で一元的に情報を管理している。
国立長寿医療研究センターは、電子カルテシステムと連係するバイオバンク検体運用管理システムを運用。そのプラットフォームにはデータベースアプリ開発ツール「FileMaker」を採用し、FileMakerによる医療システム構築の実績があるジュッポーグループと共同で開発した。
「システムの開発当時はバイオバンク業務のワークフローすら明確に定まっていない状況にあった。そのため、アジャイル型の開発手法を採用してプロトタイプを作成しながら、現場でのヒアリングを踏まえて改良を重ねてきた」。国立長寿医療研究センター バイオバンク 情報管理ユニット長の渡辺 浩氏は、こう語る。また、FileMakerを採用した理由について同氏は、実装とテストを反復しながら進めるアジャイル開発が可能である点を挙げる。
FileMakerを基盤とする「バイオバンク検体運用管理システム」
バイオバンク検体運用管理システムは、個別の機能を持つ4つのモジュールで構成。セキュリティを高めるため、既存の病院や研究棟のネットワークに加え、新たにDMZ(非武装地帯)を設けてモジュールを配置している。
「同意書モジュール」は、患者から生体試料提供の意思確認を得た際の同意情報を管理する。同意取得業務では、意思確認文書を米Appleのタブレット「iPad」にダウンロードし、コンシェルジュが患者に対面説明した上でオフラインで同意処理を実施。コンシェルジュは、iPadを使って同意依頼を確認し、同意状況などを入力する。
「SS-MIX連係モジュール」は、電子カルテに接続する「SS-MIX標準化ストレージ」から必要な情報を取得するインタフェース機能を提供する。SS-MIX標準化ストレージは、厚生労働省電子的診療情報交換推進事業(SS-MIX)が策定したストレージ仕様だ。SS-MIX連係モジュールは、このSS-MIX標準化ストレージに格納されている「HL7」(医療分野におけるメッセージ交換の標準化規格)形式の各種データを解析し、必要な情報を取得する。
「匿名化モジュール」は、臨床情報と検体情報をひも付ける際、電子カルテにある患者の個人情報を匿名化するための機能だ。同システムでは、患者IDをリソース番号(生体試料管理番号)に変換し、照合表で情報を管理する。また、患者IDとは別にバイオバンク登録番号をモジュール内で発番して管理。それらによって、患者IDが不明な場合でも同一患者からの提供リソースであることを認識可能にしているという。
バイオバンクでは、検体情報を分譲した研究者から臨床情報を追加請求されることもある。そのため、電子カルテの臨床情報に戻ってデータを再取得する必要がある。渡辺氏は、「匿名化モジュールを病院情報ネットワークと研究棟のネットワークの中間(DMZ)に配置し、病院側からはリソース番号が、バイオバンク側からは患者IDが認識できない仕組みを構築している」と説明する。
「検体管理モジュール」は、血清や血漿、DNAなど生体試料の種別と保管場所情報を管理する。分注処理画面では自動的に検体番号を発番し、分注処理時には自動的に保管場所の指示データを作成。担当者は指示データの内容を確認し、指定された場所に検体を保管する。また同モジュールは、設定値をマスター化し、検体を同一種類などに分注する際の繰り返し入力を省力化する機能を備える。
長寿医療研究センターは、保管指示の確認と保管処理をiPadで実施。分注した生体試料をフリーザーや液体窒素保存タンクに保存する際、各部屋に常備したiPadに場所情報を入力しながら作業するという。
渡辺氏は、モジュール化のメリットとして「バイオバンク業務プロセスのさまざまなワークフローに柔軟に対応できる」点を挙げる。また、「匿名化/連結不可」「未匿名/連結可能」という複数の条件で情報を管理できると説明。さらに「ワークフローに違いがある他のナショナルセンターのバイオバンク業務にも適用できる可能性がある」と期待を込める。長寿医療研究センターは今後、バイオバンク以外の研究での活用も視野に入れる。同システムのセキュリティや利便性を強化し、データベースのカタログ化を検討しているという。
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